Characterization of Pin m III cDNA in western white pine
Notice bibliographique
Résumé
Maximum accumulation of Pin m III protein in western white pine (Pinus monticola Dougl. ex D. Don) needles occurred during the winter months. To characterize Pin m III, an expression cDNA library from poly(A)+ mRNA of needles was immunoscreened and the full length cDNA was cloned. An open reading frame of 486 bases encodes a protein of 161 amino acid residues with a molecular mass of 18 kD and a predicted isoelectric point of 5.5. The deduced amino acid sequence had some similarities (37%) with an intracellular pathogenesis-related (PR) protein from garden asparagus (Asparagus officinalis L.) and the major pollen allergen from white birch (Betula verrucosa J. F. Ehrh.), which are members of the ribonuclease-like PR-10 family. Phylogenetic analysis provided circumstantial evidence that Pin m III may be grouped with intracellular PRs from asparagus and potato (Solanum tuberosum L.), while the allergens formed another subgroup. Northern analysis showed that the Pin m III gene was preferentially expressed during cold acclimation with the highest expression in the fall and winter months, preceding the peak of Pin m III protein accumulation. Tissue specificity expression analysis indicated that the gene was strongly expressed in roots and twigs. Higher amounts of the homologous protein (Pin l I) and its transcript accumulated in sugar pine (Pinus lambertiana Dougl.) needles infected with blister rust compared with healthy needles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».