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Enregistrement W1990711970 · doi:10.1093/treephys/20.10.663

Characterization of Pin m III cDNA in western white pine

2000· article· en· W1990711970 sur OpenAlexafffund
X. Yu, A.K.M. Ekramoddoullah, Santosh Misra

Notice bibliographique

RevueTree Physiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of VictoriaNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesCanadian Forest ServiceU.S. Forest Service
Mots-clésAsparagusComplementary DNABiologyBotanyOpen reading framecDNA libraryGeneMolecular biologyPeptide sequenceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maximum accumulation of Pin m III protein in western white pine (Pinus monticola Dougl. ex D. Don) needles occurred during the winter months. To characterize Pin m III, an expression cDNA library from poly(A)+ mRNA of needles was immunoscreened and the full length cDNA was cloned. An open reading frame of 486 bases encodes a protein of 161 amino acid residues with a molecular mass of 18 kD and a predicted isoelectric point of 5.5. The deduced amino acid sequence had some similarities (37%) with an intracellular pathogenesis-related (PR) protein from garden asparagus (Asparagus officinalis L.) and the major pollen allergen from white birch (Betula verrucosa J. F. Ehrh.), which are members of the ribonuclease-like PR-10 family. Phylogenetic analysis provided circumstantial evidence that Pin m III may be grouped with intracellular PRs from asparagus and potato (Solanum tuberosum L.), while the allergens formed another subgroup. Northern analysis showed that the Pin m III gene was preferentially expressed during cold acclimation with the highest expression in the fall and winter months, preceding the peak of Pin m III protein accumulation. Tissue specificity expression analysis indicated that the gene was strongly expressed in roots and twigs. Higher amounts of the homologous protein (Pin l I) and its transcript accumulated in sugar pine (Pinus lambertiana Dougl.) needles infected with blister rust compared with healthy needles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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