A microfluidic study of mechanisms in the electrophoresis of supercoiled DNA
Notice bibliographique
Résumé
In this work, microfluidic chips were used to study the electrophoresis of supercoiled DNA (SC DNA) in agarose. This system allowed us to study the electrophoretic and trapping behaviours of SC DNA of various lengths, at various fields and separation distances. Near a critical electric field the DNA is trapped such that the concentration falls exponentially with distance. The trapping of such circular DNA has been explained in terms of the 'lobster trap' or 'impalement' model where shorter fibres become trapping sites at higher fields, leading to an ongoing (and gradual) increase in trapping with increasing field. By contrast, the present study suggests that under some circumstances the traps have a barrier such that only when the DNA has sufficient energy (at high enough fields) can it become trapped, leading to a sudden transition in behaviours at the critical field. We propose an 'activated impalement' mechanism of trapping in which only at sufficiently high fields is the SC DNA impaled and trapped for long times. The critical electric field appears to be inversely proportional to the length of the DNA molecule, suggesting that the force required to impale the SC DNA is constant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».