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Enregistrement W1990730191 · doi:10.1016/j.jcv.2014.06.020

Evolution of an influenza pandemic in 13 countries from 5 continents monitored by protein microarray from neonatal screening bloodspots

2014· article· en· W1990730191 sur OpenAlexaboutno aff
Erwin de Bruin, J.G. Loeber, Adam Meijer, G. Martinez Castillo, Martha Cepeda, M. Rosario Torres-Sepúlveda, Gustavo Borrajo, Michele Caggana, Y. Giguere, Maxence Meyer, Masaru Fukushi, A. Renuka Devi, Issam Khneisser, Laura Vilarinho, U. von Döbeln, T. Torresani, J. S. Mackenzie, Ilse Zutt, Maarten Schipper, L.H. Elvers, Marion Koopmans

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Virology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu
Mots-clésPandemicVirologySeroprevalenceMedicineOutbreakPopulationVirusInfluenza A virusSerologyImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Environmental healthInternal medicineAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Because of lack of worldwide standardization of influenza virus surveillance, comparison between countries of impact of a pandemic is challenging. For that, other approaches to allow internationally comparative serosurveys are welcome. OBJECTIVES: Here we explore the use of neonatal screening dried blood spots to monitor the trends of the 2009 influenza A (H1N1) pdm virus by the use of a protein microarray. STUDY DESIGN: We contacted colleagues from neonatal screening laboratories and asked for their willingness to participate in a study by testing anonymized neonatal screening bloodspots collected during the course of the pandemic. In total, 7749 dried blood spots from 13 countries in 5 continents where analyzed by using a protein microarray containing HA1 recombinant proteins derived from pandemic influenza A (H1N1) 2009 as well as seasonal influenza viruses. RESULTS: Results confirm the early start of the pandemic with extensive circulation in the US and Canada, when circulation of the new virus was limited in other parts of the world. The data collected from sites in Mexico suggested limited circulation of the virus during the early pandemic phase in this country. In contrast and to our surprise, an increase in seroprevalence early in 2009 was noted in the dataset from Argentina, suggestive of much more widespread circulation of the novel virus in this country than in Mexico. CONCLUSIONS: We conclude that this uniform serological testing of samples from a highly standardized screening system offers an interesting opportunity for monitoring population level attack rates of widespread diseases outbreaks and pandemics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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