MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1990750977 · doi:10.1002/humu.20601

Germline and somaticNF1 gene mutation spectrum in NF1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs)

2007· article· en· W1990750977 sur OpenAlex
Meena Upadhyaya, Lan Kluwe, Gillian Spurlock, Bisma Monem, Elisa Majounie, Kiran K. Mantripragada, Martino Ruggieri, Nadia Chuzhanova, D. Gareth Evans, Rosalie E. Ferner, Nick Thomas, A. Guha, Victor Mautner

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesCancer Research UK
Mots-clésBiologyGermlineCancer researchGermline mutationMutationMalignant peripheral nerve sheath tumorGeneGeneticsNeurofibromatosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

About 10% of neurofibromatosis type 1 (NF1) patients develop malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) and represent considerable patient morbidity and mortality. Elucidation of the genetic mechanisms by which inherited and acquired NF1 disease gene variants lead to MPNST development is important. A study was undertaken to identify the constitutional and somatic NF1 mutations in 34 MPNSTs from 27 NF1 patients. The NF1 germline mutations identified in 22 lymphocytes DNA from these patients included seven novel mutations and a large 1.4-Mb deletion. The NF1 germline mutation spectrum was similar to that previously identified in adult NF1 patients without MPNST. Somatic NF1 mutations were identified in tumor DNA from 31 out of 34 MPNSTs, of which 28 were large genomic deletions. The high prevalence (>90%) of such deletions in MPNST contrast with the =or<20% found in benign neurofibromas and is indicative of the involvement of different mutational mechanisms in these tumors. Coinactivation of the TP53 gene by deletion, or by point mutation along with NF1 gene inactivation, is known to exacerbate disease symptoms in NF1, therefore TP53 gene inactivation was screened. DNA from 20 tumors showed evidence for loss of heterozygosity (LOH) across the TP53 region in 11 samples, with novel TP53 point mutations in four tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,560
Score d'incertitude au seuil0,698

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle