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Enregistrement W1990873918 · doi:10.1086/668778

Nosocomial Transmission of New Delhi Metallo-<i>β</i>-Lactamase-1-Producing<i>Klebsiella pneumoniae</i>in Toronto, Canada

2012· article· en· W1990873918 sur OpenAlexafffundabout
Christopher F. Lowe, Julianne V. Kus, Natasha Salt, Sandra Callery, Lisa Louie, Mohammed Khan, Mary Vearncombe, Andrew E. Simor

Notice bibliographique

RevueInfection Control and Hospital Epidemiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMedicineOdds ratioKlebsiella pneumoniaeRetrospective cohort studyInternal medicineEpidemiologyPulsed-field gel electrophoresisMicrobiologyVeterinary medicineBiologyGenotypeEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DESIGN: An analysis of a cluster of New Delhi metallo-β-lactamase-1-producing Klebsiella pneumoniae (NDM1-Kp) and a retrospective case-cohort analysis of risk factors for acquisition in contacts of NDM1-Kp-positive patients. SETTING: A 1,100-bed Canadian academic tertiary care center. PATIENTS: Two index patients positive for NDM1-Kp as well as 45 contacts (roommates, ward mates, or environmental contacts) were investigated. METHODS: Retrospective chart reviews of all patients colonized or infected with NDM1-Kp as well as contacts of these patients were performed in order to describe the epidemiology and impact of infection prevention and control measures. A case-cohort analysis was conducted investigating 45 contacts of NDM1-Kp-positive patients to determine risk factors for acquisition of NDM1-Kp. Rectal swabs were screened for NDM1-Kp using chromogenic agar. Presence of bla(NDM-1) was confirmed by multiplex polymerase chain reaction. Clonality was assessed with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using restriction enzyme XbaI. RESULTS: Two index cases carrying NDM1-Kp with different PFGE patterns were identified. Nosocomial transmission to 7 patients (4 roommates, 2 ward mates, and 1 environmental contact) was subsequently identified. Risk factors for acquisition of NDM1-Kp were a history of prior receipt of certain antibiotics (fluoroquinolones [odds ratio (OR), 16.8 (95% confidence interval [CI], 1.30-58.8); [Formula: see text]], trimethoprim-sulfamethoxazole [OR, 11.3 (95% CI, 1.84-70.0); [Formula: see text]], and carbapenems [OR, 16.8 (95% CI, 1.79-157.3); [Formula: see text]]) and duration of exposure to NDM1-Kp-positive roommates (26.5 vs 6.7 days; [Formula: see text]). CONCLUSION: Two distinct clones of NDM1-Kp were transmitted to 7 inpatient contacts over several months. Implementation of contact precautions, screening of contacts for NDM1-Kp carriage, and attention to environmental disinfection contributed to the interruption of subsequent spread of the organism. The appropriate duration and frequency of screening contacts of NDM1-Kp-positive patients require further study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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