Common Sequence Variation in <i>FLNB</i> Regulates Bone Structure in Women in the General Population and <i>FLNB</i> mRNA Expression in Osteoblasts In Vitro
Notice bibliographique
Résumé
Previous data from our group indicate that BMD is linked to chromosome 3p14-p21. Because the filamin B (FLNB gene resides in this region, is the cause of skeletal dysplasias, and was identified among the top genes in our bioinformatics analysis, we hypothesized a role for FLNB in the regulation of bone structure in the general population. Using a tag single nucleotide polymorphism (SNP) approach, a family study of 767 female sibs in which the 3p14-p21 linkage with BMD was previously shown was examined. FLNB variants showing a BMD association were tested in two additional data sets, a study of 1085 UK female twins and a population study (CAIFOS) of 1315 Australian women. Genotype-expression studies were performed in 96 human osteoblast lines to examine the variants in vitro. rs7637505, rs9822918, rs2177153, and rs2001972 showed association with femoral neck (p = 0.0002-0.02) in the family-based study. The twin study provided further support for an association between rs7637505 and femoral neck and spine BMD (p = 0.02-0.03). The CAIFOS study further suggested an association between rs2177153 and rs9822918 and femoral neck BMD (p = 0.004-0.03). Prevalent fractures were increased in carriers of the A allele of rs2177153 (p = 0.009). In vitro studies showed association between rs11130605, itself in strong LD with rs7637505, and FLNB mRNA expression. These findings suggest common variants in FLNB have effects on bone structure in women. Although the location of variants having effects is not entirely consistent, variation at the 5' end of the gene may reflect effects on levels of FLNB transcription efficiency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».