Integrin β cytoplasmic domain interactions with phosphotyrosine-binding domains: A structural prototype for diversity in integrin signaling
Notice bibliographique
Résumé
The cytoplasmic domains (tails) of heterodimeric integrin adhesion receptors mediate integrins' biological functions by binding to cytoplasmic proteins. Most integrin beta tails contain one or two NPXYF motifs that can form beta turns. These motifs are part of a canonical recognition sequence for phosphotyrosine-binding (PTB) domains, protein modules that are present in a wide variety of signaling and cytoskeletal proteins. Indeed, talin and ICAP1-alpha bind to integrin beta tails by means of a PTB domain-NPXY ligand interaction. To assess the generality of this interaction we examined the binding of a series of recombinant PTB domains to a panel of short integrin beta tails. In addition to the known integrin-binding proteins, we found that Numb (a negative regulator of Notch signaling) and Dok-1 (a signaling adaptor involved in cell migration) and their isolated PTB domain bound to integrin tails. Furthermore, Dok-1 physically associated with integrin alpha IIb beta 3. Mutations of the integrin beta tails confirmed that these interactions are canonical PTB domain-ligand interactions. First, the interactions were blocked by mutation of an NPXY motif in the integrin tail. Second, integrin class-specific interactions were observed with the PTB domains of Dab, EPS8, and tensin. We used this specificity, and a molecular model of an integrin beta tail-PTB domain interaction to predict critical interacting residues. The importance of these residues was confirmed by generation of gain- and loss-of-function mutations in beta 7 and beta 3 tails. These data establish that short integrin beta tails interact with a large number of PTB domain-containing proteins through a structurally conserved mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».