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Enregistrement W1991215169 · doi:10.1021/bi0020574

Rhodamine 123 Binds to Multiple Sites in the Multidrug Resistance Protein (MRP1)

2000· article· en· W1991215169 sur OpenAlexaff
Roni Daoud, Christina Kast, Piet Gros, Elias Georges

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHeLaPhotoaffinity labelingImmunoprecipitationMolecular biologyRhodamine 123ChemistryBiochemistryCytosolTransfectionRhodamineBiologyBinding siteMultiple drug resistanceIn vitroFluorescenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanisms of MRP1-drug binding and transport are not clear. In this study, we have characterized the interaction between MRP1 and rhodamine 123 (Rh123) using the photoreactive-iodinated analogue, [(125)I]iodoaryl azido-rhodamine 123 (or IAARh123). Photoaffinity labeling of plasma membranes from HeLa cells transfected with MRP1 cDNA (HeLa-MRP1) with IAARh123 shows the photolabeling of a 190 kDa polypeptide not labeled in HeLa cells transfected with the vector alone. Immunoprecipitation of a 190 kDa photolabeled protein with MRP1-sepcific monoclonal antibodies (QCRL-1, MRPr1, and MRPm6) confirmed the identity of this protein as MRP1. Analysis of MRP1-IAARh123 interactions showed that photolabeling of membranes from HeLa-MRP1 with increasing concentrations of IAARh123 was saturable, and was inhibited with excess of IAARh123. Furthermore, the photoaffinity labeling of MRP1 with IAARh123 was greatly reduced in the presence of excess Leukotreine C(4) or MK571, but to a lesser extent with excess doxorubicin, colchicine or chloroquine. Cell growth assays showed 5-fold and 14-fold increase in the IC(50) of HeLa-MRP1 to Rh123 and the Etoposide VP16 relative to HeLa cells, respectively. Analysis of Rh123 fluorescence in HeLa and HeLa-MRP1 cells with or without ATP suggests that cross-resistance to Rh123 is in part due to reduced drug accumulation in the cytosol of HeLa-MRP1 cells. Mild digestion of purified IAARh123-photolabeled MRP1 with trypsin showed two large polypeptides (approximately 111 and approximately 85 kDa) resulting from cleavage in the linker domain (L1) connecting the multiple-spanning domains MSD0 and MSD1 to MSD2. Exhaustive proteolysis of purified IAARh123-labeled 85 and 111 kDa polypeptides revealed one (6 kDa) and two (approximately 6 plus 4 kDa) photolabeled peptides, respectively. Resolution of total tryptic digest of IAARh123-labeled MRP1 by HPLC showed three radiolabeled peaks consistent with the three Staphylococcus aureus V8 cleaved peptides from the Cleveland maps. Together, the results of this study show direct binding of IAARh123 to three sites that localize to the N- and C-domains of MRP1. Moreover, IAARh123 provides a sensitive and specific probe to study MRP1-drug interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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