Lipidomics of Candida albicans biofilms reveals phase-dependent production of phospholipid molecular classes and role for lipid rafts in biofilm formation
Notice bibliographique
Résumé
Candida albicans-associated bloodstream infections are linked to the ability of this yeast to form biofilms. In this study, we used lipidomics to compare the lipid profiles of C. albicans biofilms and planktonic cells, in early and mature developmental phases. Our results showed that significant differences exist in lipid composition in both developmental phases. Biofilms contained higher levels of phospholipid and sphingolipids than planktonic cells (nmol per g biomass, P<0.05 for all comparisons). In the early phase, levels of lipid in most classes were significantly higher in biofilms compared to planktonic cells (P≤0.05). The ratio of phosphatidylcholine to phosphatidylethanolamine was lower in biofilms compared to planktonic cells in both early (1.17 vs 2.52, P≤0.001) and late (2.34 vs 3.81, P≤0.001) developmental phases. The unsaturation index of phospholipids decreased with time, with this effect being particularly strong for biofilms. Inhibition of the biosynthetic pathway for sphingolipid [mannosyl diinositolphosphoryl ceramide, M(IP)₂C] by myriocin or aureobasidin A, and disruption of the gene encoding inositolphosphotransferase (Ipt1p), abrogated the ability of C. albicans to form biofilms. The differences in lipid profiles between biofilms and planktonic Candida cells may have important implications for the biology and antifungal resistance of biofilms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».