Determinants of Intestinal Permeability in Healthy First-Degree Relatives of Individuals with Crohnʼs Disease
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Genetics, Environmental, Microbial Project is a multicenter study assessing etiological factors in Crohn's disease by studying healthy first-degree relatives (FDRs) of individuals affected by Crohn's disease. We aimed to evaluate the contribution of genetic, microbial, and environmental factors to the determination of intestinal permeability in healthy FDRs. METHODS: IP was assessed using the lactulose-mannitol ratio (LacMan ratio). FDRs were genotyped for 167 inflammatory bowel disease-associated single nucleotide polymorphisms. Taxonomic profile of the fecal microbiota was determined by Illumina MiSeq pyrosequencing of 16S ribosomal RNA. The associations of LacMan ratio with demographic factors, inflammatory bowel disease-associated single nucleotide polymorphisms and the fecal microbiota were assessed. RESULTS: One thousand, one hundred ninety-six white FDRs were included [corrected]. Eleven percent of FDRs had an elevated LacMan ratio (≥0.03). A multivariate analysis demonstrated that younger subjects and nonsmokers had higher LacMan ratios, P = 3.62 × 10⁻⁴ and P = 0.03, respectively. The LacMan ratio was not significantly heritable, H2r, 0.13, P = 0.13. There was no association between any of the 167 inflammatory bowel disease-associated risk variants and LacMan ratio nor was there a correlation between fecal microbial composition and the LacMan ratio. CONCLUSIONS: We did not find LacMan ratio to be significantly heritable suggesting that the contribution of genetic factors to the determination of intestinal permeability in healthy FDRs is modest. Environmental factors, such as smoking, are likely more important determinants. The effect of age on intestinal barrier function has been underappreciated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».