Multiplexed PCR to screen for a major QTL carrying fusarium head blight resistance in Sumai-3 wheat
Notice bibliographique
Résumé
After the initial identification of microsatellites linked to economically important traits of interest, the additional investment to simplify the screening procedure for more routine use is of interest to plant breeders. The objective was to simplify an acrylamide gel based marker-assisted selection (MAS) method to facilitate high-through put screening for Qfhs.ndsu-3BS, a major quantitative trait locus carrying fusarium head blight (FHB) resistance in Sumai-3 wheat (Triticum aestivum L.). Method simplifications included incorporating the use of (1) 96-well DNA extractions, (2) multiplexed PCR reactions using microsatellite primers gwm493 and gwm533, and (3) agarose gels. Our modified FHB-MAS method was verified by screening six resistant (Sumai-3, ND2710, McVey, BacUp, HY644, and Alsen) and 52 susceptible parents and subsequently used to screen 5567 common wheat breeding lines developed from Sumai-3 derivatives. This simple and rapid method allows for the screening of 1000 lines per week, which can be used to skew segregating populations towards more resistant types and thereby advance primarily early and advanced generation lines that carry at least the major FHB QTL. Key words: PCR, Fusarium, microsatellites, gwm493, gwm533, Triticum
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».