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Enregistrement W1991303913 · doi:10.1002/ijc.21116

Subtype-specific expression and genetic alterations of the chemokinereceptor geneCXCR4 in medulloblastomas

2005· article· en· W1991303913 sur OpenAlexaff
Ulrich Schüller, Arend Koch, Wolfgang Hartmann, Maria Luisa Garrè, Cynthia G. Goodyer, Armando Cama, Niels Sörensen, Otmar D. Wiestler, Torsten Pietsch

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyMedulloblastomaGeneticsExpression (computer science)Evolutionary biologyNeuroscienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent findings indicate that the chemokine receptor Cxcr4 is essential for normal development of the cerebellar cortex. As medulloblastomas (MBs), the most common malignant brain tumors of childhood, are believed to arise from neuronal cerebellar precursors, we asked whether there is a potential role for Cxcr4 in the pathogenesis of MB. RT-PCR and immunohistochemistry revealed expression of Cxcr4 in different variants of MBs. Whereas 18/20 classic MBs showed very low levels of CXCR4 mRNA, high amounts were expressed in 17/18 desmoplastic and 6/7 extensively nodular MBs. In addition, a significant correlation of high CXCR4 mRNA levels and presence of the neurotrophin receptor p75NTR or expression of ATOH1 and GLI1 suggests that CXCR4 is a reliable marker for tumors derived from the cerebellar external granular layer. Because Cxcr4 is important for migration and cell cycle control of granular precursors, we screened for mutations in the coding region by SSCP and gene sequencing. In a series of 90 MBs and 8 MB cell lines, we found one germline and one somatic mutation resulting in amino acid substitutions in the first (Ile53Leu) and second (Asp97Asn) transmembrane regions, respectively. These data suggest that Cxcr4 may be involved in the pathogenesis of MBs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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