Subtype-specific expression and genetic alterations of the chemokinereceptor geneCXCR4 in medulloblastomas
Notice bibliographique
Résumé
Recent findings indicate that the chemokine receptor Cxcr4 is essential for normal development of the cerebellar cortex. As medulloblastomas (MBs), the most common malignant brain tumors of childhood, are believed to arise from neuronal cerebellar precursors, we asked whether there is a potential role for Cxcr4 in the pathogenesis of MB. RT-PCR and immunohistochemistry revealed expression of Cxcr4 in different variants of MBs. Whereas 18/20 classic MBs showed very low levels of CXCR4 mRNA, high amounts were expressed in 17/18 desmoplastic and 6/7 extensively nodular MBs. In addition, a significant correlation of high CXCR4 mRNA levels and presence of the neurotrophin receptor p75NTR or expression of ATOH1 and GLI1 suggests that CXCR4 is a reliable marker for tumors derived from the cerebellar external granular layer. Because Cxcr4 is important for migration and cell cycle control of granular precursors, we screened for mutations in the coding region by SSCP and gene sequencing. In a series of 90 MBs and 8 MB cell lines, we found one germline and one somatic mutation resulting in amino acid substitutions in the first (Ile53Leu) and second (Asp97Asn) transmembrane regions, respectively. These data suggest that Cxcr4 may be involved in the pathogenesis of MBs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».