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Enregistrement W1991312750 · doi:10.2500/ajra.2009.23.3303

Evidence of Association of Interleukin-1 Receptor-Like 1 Gene Polymorphisms with Chronic Rhinosinusitis

2009· article· en· W1991312750 sur OpenAlexaff
Roberto Castaño, Yohan Bossé, Léandra Mfuna Endam, Martin Desrosiers

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Rhinology and Allergy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensMcGill UniversityInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité de MontréalUniversité LavalHôtel-Dieu de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismLinkage disequilibriumMedicineHaplotypeOdds ratioInternational HapMap ProjectGeneticsImmunologyAlleleGeneGenotypeBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Chronic rhinosinusitis (CRS) is a common complex respiratory disease, with a potential genetic component to its development. The protein encoded by the Interleukin-1 receptor-like 1 (IL1RL1) gene is an important effector molecule of T-helper type 2 responses and may potentially be involved in the persistent inflammatory process observed in CRS. We investigated whether certain polymorphisms in the IL1RL1 gene are differentially present in patients with surgery-unresponsive CRS and in control subjects. METHODS: DNA extracted from an existing population of 206 adult patients with surgery-unresponsive CRS and 196 postal-code-matched controls was used. A set of 15 tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs) was selected from the HapMap data set and genotyped. DNA sequencing was performed in a subgroup of 15 CRS patients. RESULTS: Statistically significant allelic associations with CRS were noted for 5 SNPs (rs10204137, p = 0.04; rs10208293, p = 0.03; rs13431828, p = 0.008; rs2160203, p = 0.03, and rs4988957, p = 0.03). The analysis showed a consistent significant protective effect against CRS for all the SNPs, yielding an odds ratio (OR) ranging from 0.56 to 0.72. The loci rs13431828 showed the highest association with CRS (p = 0.008; OR = 0.56; 95% CI, 0.36-0.86). A subanalysis revealed that the observed associations were stronger among patients with more severe disease. Sequencing identified five additional known nonsynonymous coding SNPs in linkage disequilibrium with genotyped SNPs. CONCLUSION: Pending replication of these results, this study suggests that polymorphisms within the IL1RL1 gene may be associated with CRS, conferring a protective effect, particularly among those with severe disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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