Genes of<i>Escherichia coli</i>O157:H7 That Are Involved in High-Pressure Resistance
Notice bibliographique
Résumé
Seventeen Escherichia coli O157:H7 strains were treated with ultrahigh pressure at 500 MPa and 23 +/- 2 degrees C for 1 min. This treatment inactivated 0.6 to 3.4 log CFU/ml, depending on the strain. The diversity of these strains was confirmed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) analysis, and there was no apparent association between PFGE banding patterns and pressure resistance. The pressure-resistant strain E. coli O157:H7 EC-88 (0.6-log decrease) and the pressure-sensitive strain ATCC 35150 (3.4-log decrease) were treated with a sublethal pressure (100 MPa for 15 min at 23 +/- 2 degrees C) and subjected to DNA microarray analysis using an E. coli K-12 antisense gene chip. High pressure affected the transcription of many genes involved in a variety of intracellular mechanisms of EC-88, including the stress response, the thiol-disulfide redox system, Fe-S cluster assembly, and spontaneous mutation. Twenty-four E. coli isogenic pairs with mutations in the genes regulated by the pressure treatment were treated with lethal pressures at 400 MPa and 23 +/- 2 degrees C for 5 min. The barotolerance of the mutants relative to that of the wild-type strains helped to explain the results obtained by DNA microarray analysis. This study is the first report to demonstrate that the expression of Fe-S cluster assembly proteins and the fumarate nitrate reductase regulator decreases the resistance to pressure, while sigma factor (RpoE), lipoprotein (NlpI), thioredoxin (TrxA), thioredoxin reductase (TrxB), a trehalose synthesis protein (OtsA), and a DNA-binding protein (Dps) promote barotolerance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».