Retrovirus Silencing, Variegation, Extinction, and Memory Are Controlled by a Dynamic Interplay of Multiple Epigenetic Modifications
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Retrovirus silencing in stem cells produces silent or variegated provirus. Additional memory and extinction mechanisms act during differentiation. Here we show that retrovirus is silent or variegated in mouse embryonic stem (ES) cells that are de novo methyltransferase (dnmt3a and dnmt3b) null. Memory is maintained during differentiation, and extinction occurs on variegated retrovirus, indicating that DNA methylation is dispensable for all forms of retrovirus silencing. Silent and variegated provirus are marked by hypoacetylated histone H3 and bound H1. In wild-type ES cells, silent and variegated proviruses are methylated and bound by hypoacetylated H3, MeCP2, and less H1. Silencing, variegation, and extinction are partially reactivated by 5-AzaC in this context. Lentivirus vectors are also silent or variegated, marked by silent chromatin, and exhibit memory and extinction. We conclude that the universal epigenetic mark of retrovirus silencing is silent chromatin established via the dynamic interplay of multiple epigenetic modifications that include but do not require DNA methylation. A molecular mechanism of competitive H1 and MeCP2 binding may account for this epigenetic interplay, and a model for variegation is discussed.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle