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Enregistrement W1991493381 · doi:10.1117/12.795378

What do membrane lipids tell us about the microorganisms living in extreme environments?

2008· article· en· W1991493381 sur OpenAlexfundaboutno aff
Susan M. Pfiffner, Sarah DiFurio, Ying-Dong M. Gan, Richard B. Hoover

Notice bibliographique

RevueProceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering/Proceedings of SPIE · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNASA Astrobiology InstituteNuclear Waste Management Organization
Mots-clésEnvironmental chemistryBiomass (ecology)Extreme environmentBoreholeAnoxic watersMicroorganismEnvironmental scienceMicrobial population biologyChemistryBacteriaBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To search for extraterrestrial life surrogate extreme environments on Earth have been chosen for investigation. An example of a surrogate site is the Canadian subpermafrost. Investigations into microbial communities occurred by access fracture borehole water in the Lupin gold mine, and drill rock cores and drilling waters in the High Lake region of Nunavut, Canada. Membrane lipid analyses uses GC/MS and HPLC/ES/MS/MS to provide estimates of biomass, phospholipid (PLFA) and respiratory quinone composition, and compositional changes related to membrane stress caused by nutritional limitations or exposure to toxic conditions. Lupin fracture borehole waters were collected from 800 to 1200 meters, while the High Lake rock cores were collected from 335 to 535 meters. Biomass estimates based on PLFA ranged from 0.25 to 22 pmol L-1 for the Lupin waters. High Lake drill waters had biomass that ranged from below detection limits (bdl) to 595 pmol/ml, while rock core samples had biomass estimates ranging from bdl to 32 pmol g-1. PLFA profiles revealed the presence of both Gram +/- bacteria and sulfatereducing bacteria. Specific PLFA ratios indicate that the bacterial communities were physiologically stressed. Menaquinones were the most abundant but varied in the dominant isoprene units between the two sites. Ubiquinone to menaquinone ratio indicated that these samples have been anoxic for a long time. Methods to detect life signatures at surrogate sites on Earth will be critical for assessing extraterrestrial life. Currently, the membrane lipid analyses provide additional information not easily provided by other molecular techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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