The pool of preactivated Lck in the initiation of T‐cell signaling: a critical re‐evaluation of the Lck standby model
Notice bibliographique
Résumé
The initiation of T-cell receptor (TCR) signaling, based on the cobinding of TCR and CD4-Lck heterodimer to a peptide-major histocompatibility complex II on antigen presenting cells, represents a classical model of T-cell signaling. What is less clear however, is the mechanism which translates TCR engagement to the phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based activation motifs on CD3 chains and how this event is coupled to the delivery of Lck function. Recently proposed 'standby model of Lck' posits that resting T-cells contain an abundant pool of constitutively active Lck (pY394(Lck)) required for TCR triggering, and this amount, upon TCR engagement, remains constant. Here, we show that although maintenance of the limited pool of pY394(Lck) is necessary for the generation of TCR proximal signals in a time-restricted fashion, the total amount of this pool, ~2%, is much smaller than previously reported (~40%). We provide evidence that this dramatic discrepancy in the content of pY394(Lck)is likely the consequence of spontaneous phosphorylation of Lck that occurred after cell solubilization. Additional discrepancies can be accounted for by the sensitivity of different pY394(Lck)-specific antibodies and the type of detergents used. These data suggest that reagents and conditions used for the quantification of signaling parameters must be carefully validated and interpreted. Thus, the limited size of pY394(Lck) pool in primary T-cells invites a discussion regarding the adjustment of the quantitative parameters of the standby model of Lck and reevaluation of the mechanism by which this pool contributes to the generation of proximal TCR signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».