The Brassica oleracea genome reveals the asymmetrical evolution of polyploid genomes

2014· article· en· 1 232 citations· W1991552254 sur OpenAlex· 10.1038/ncomms4930

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,015

Tête enseignante GPT0,242

Écart entre enseignants: 0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Polyploidization has provided much genetic variation for plant adaptive evolution, but the mechanisms by which the molecular evolution of polyploid genomes establishes genetic architecture underlying species differentiation are unclear. Brassica is an ideal model to increase knowledge of polyploid evolution. Here we describe a draft genome sequence of Brassica oleracea, comparing it with that of its sister species B. rapa to reveal numerous chromosome rearrangements and asymmetrical gene loss in duplicated genomic blocks, asymmetrical amplification of transposable elements, differential gene co-retention for specific pathways and variation in gene expression, including alternative splicing, among a large number of paralogous and orthologous genes. Genes related to the production of anticancer phytochemicals and morphological variations illustrate consequences of genome duplication and gene divergence, imparting biochemical and morphological variation to B. oleracea. This study provides insights into Brassica genome evolution and will underpin research into the many important crops in this genus. Brassica oleracea is plant species comprising economically important vegetable crops. Here, the authors report the draft genome sequence of B. oleracea and, through a comparative analysis with the closely related B. rapa, reveal insights into Brassicaevolution and divergence of interspecific genomes and intraspecific subgenomes.

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La notice

Revue: Nature Communications
Thématique: Chromosomal and Genetic Variations
Domaine: Agricultural and Biological Sciences
Établissements canadiens: National Research Council CanadaSaskatchewan Research Council (Canada)Agriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnaires: National Key Research and Development Program of ChinaSpecial Fund for Agro-scientific Research in the Public InterestAustralian Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesNational Natural Science Foundation of ChinaNational Science Foundation
Mots-clés: BiologyBrassica oleraceaPolyploidGenomeGenome evolutionBrassica rapaGenome sizeGeneticsGenePloidyGene duplicationTandem exon duplicationTransposable elementPlant evolutionEvolutionary biologyBotany
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W1991552254