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Enregistrement W1991639496 · doi:10.1139/b05-110

Revisions to<i>Penicillium</i>ser.<i>Corymbifera</i>: agents responsible for blue mould storage rot of various flower and vegetable bulbs

2005· article· en· W1991639496 sur OpenAlexvenueno aff
David P. Overy, J. G. Valdez, Jens C. Frisvad

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPartial least squares regressionSecondary metaboliteAgarUPGMAChemotaxonomyPhenotypeMating typeYeastBotanyStrain (injury)Linear discriminant analysisPenicilliumGeneticsTaxonomy (biology)Genetic variationGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fifteen strains representing each Penicillium ser. Corymbifera taxa were compared using phenotypic and chemotaxonomic characters by cluster analysis and discriminant partial least squares regression. Variability in phenotypic expression of species strains resulted in a more fragmented classification compared with secondary metabolite expression. Although the observed phenotypic expression varied for strains cultured upon the same media, it was possible to classify strains into species groupings based only upon a few distinctive phenotypic traits. Data analysis of secondary metabolite profiles generated from HPLC-diode array dectection analysis gave reliable strain classification when more than one media type was employed. Depending on the species, Czapek yeast autolysate agar typically yielded the greatest chemical diversity; however, several metabolites (terrestric acid, corymbiferone, the corymbiferan lactones, and daldinin D) were only produced when strains were grown on either yeast extract sucrose or oatmeal agar. For the classification of strains based on a binary data matrix, application of the Yule coefficient gave the best clustering. Several secondary metabolites, of importance for the classification of ser. Corymbifera strains, were identified by discriminant-partial least squares regression analysis. A diagnostic key based on phenotypic, chemotaxonomic, and pathogenic traits is provided as an aid for species identification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,074

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,028

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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