SLAK-1, a proposed antibody-conjugated illudin analogue that selectively targets breast cancer<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
Our improved understanding behind the molecular mechanisms of tumorigenesis has facilitated the development of novel treatments for cancer. These are often small molecule natural products which have potent cytotoxic activity that inhibit the growth of cancerous cells. However, these chemotherapeutic drugs often have multiple biochemical targets that make it difficult to selectively target cancer cells. Antibody-Drug Conjugates (ADC) are cytotoxic agents that are chemically attached to monoclonal antibodies that target cancer-specific antigens. ADCs using the humanized antibody trastuzumab can facilitate the internalization of the drug by first binding to the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) which are over expressed on the surface of breast cancer cells in aggressive tumour types. With a lower risk of off-target side-effects, we present the use of a more potent cytotoxic agent with dual anticancer modes of action known as the illudin--a novel sesquiterpene that is derived from Omphalotus mushrooms with high therapeutic value. We first propose chemical modifications of illudin analogues to maximize both affinity to glutathione reductase and DNA damaging ability. By analyzing the chemical mechanisms of cytotoxicity and carrying out protein-docking simulations, an optimized illudin analogue can be generated. We then propose the construction of SLAK-1, an ADC that consists of a HER2 targeting antibody (Trastuzumab) and an illudin analogue that are attached to each other via a non-reducible thioether linker (SMCC). L’amélioration de notre compréhension vis-à-vis les mécanismes moléculaires tumorigenèse à faciliter le développement de nouveaux traitements pour le cancer. Ce sont habituellement de petits produits naturels qui détiennent une activité cytotoxique puissante inhibant la croissance de cellules cancéreuses. Toutefois, ces médicaments chimiothérapeutiques ont souvent de multiples cibles biochimiques ce qui rend difficile de cibler sélectivement les cellules cancéreuses. Les conjugués anticorps-médicament (ADC = antibody-drug conjugate) sont des agents cytotoxiques qui sont liés chimiquement à des anticorps monoclonaux qui ciblent à leur tour des antigènes spécifiques au cancer. L’ADC utilisant l’anticorps humain Trastuzumab peut faciliter l’internalisation du médicament en se liant tout d’abord au récepteur du facteur de croissance épidermique humain 2 (HER2) qui sont surexprimés à la surface des cellules du cancer du sein dans des tumeurs de types agressifs. Avec un risque plus faible d’effets secondaires hors cible, on présente l’utilisation d’un agent cytotoxique plus puissant avec une double action anticancéreuse connu sous le nom d’illudine – un nouveau sesquiterpène dérivé du champignon Omphalotus qui détient une haute valeur thérapeutique. Nous proposons d'abord des modifications chimiques à aux analogues d’illudine afin de maximiser à la fois affinité à la réductase glutathion et à sa capacité à endommager l'ADN. En analysant les mécanismes chimiques de la cytotoxicité et en menant des simulations d’amarrage de protéines (« docking »), un analogue d’illudine optimisé peut être généré. Nous proposons ensuite la construction de SLAK-1, un ADC qui consiste d'un anticorps ciblant HER2 (Trastuzumab) et un analogue d’illudine qui sont liés entre-elles par un lien thioéther non réductible (SMCC).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».