MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1991779435 · doi:10.1159/000309852

‘Access Arrangements’ for Biobanks: A Fine Line between Facilitating and Hindering Collaboration

2010· article· en· W1991779435 sur OpenAlexafffundabout
S. Fortin, Saminda Pathmasiri, R. Grintuch, M. Deschênes

Notice bibliographique

RevuePublic Health Genomics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésBiobankPopulationWork (physics)BusinessPublic relationsPolitical scienceEngineeringMedicineEnvironmental healthBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This decade is witnessing the proliferation of large-scale population-based biobanks. Many biobanks have reached the stage of offering access to their collection of data and samples to the scientific community. This, however, requires that access arrangements be established to govern the relationship between biobanks and users. Access arrangements capture the convergence of all normative elements in the life cycle of a biobank: policies, laws, common practices, commitments made by the biobank to participants, the expectations of funders, and the needs of the scientific community. Furthermore, access arrangements shape new legal agreements between 'biobankers' and researchers to ensure appropriate, regulated and efficient use of biobank materials. This paper begins by examining the particularities of access arrangements, identifying the key elements of these new regulatory instruments. Second, the paper looks at various strategies used by biobanks to regulate access and surveys the underlying motivations of these strategies and the impact they can have on potential international collaboration. Third, an example of the challenges encountered in creating access policy is illustrated using the case of CARTaGENE, a biobank based in Montreal, Canada. Last, the paper presents how Public Population Project in Genomics (P(3)G) facilitates the work of biobankers and improves collaboration throughout the international human genomics research community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,181
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,203
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,956

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1810,203
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0270,071
Communication savante0,0390,038
Science ouverte0,0040,032
Intégrité de la recherche0,0160,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,656
Tête enseignante GPT0,614
Écart entre enseignants0,042 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePublic Health GenomicsMême sujetEthics in Clinical ResearchTravaux en français237 207