West Nile virus testing experience in 2007: evaluation of different criteria for triggering individual‐donation nucleic acid testing
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In 2007, clients served by Blood Systems Laboratories used variable approaches for triggering West Nile virus (WNV) RNA individual-donation (ID) nucleic acid testing (NAT). These included two minipool (MP) NAT-reactive donations and a greater than 1:1000 rate in a 7-day interval (primary trigger), criteria based on one MP-NAT-reactive donation when there was WNV activity in overlapping and/or adjacent geographic areas (neighbor trigger), or zero MP-NAT-reactive donation (self-trigger). STUDY DESIGN AND METHODS: The Procleix WNV assay was used in either a 16-sample MP or an ID format. NAT-repeat reactivity or anti-immunoglobulin M (IgM) positivity defined true positives (TPs). TPs that were negative on 1:16 dilution testing were considered ID-NAT yield cases. RESULTS: WNV NAT performed on 1,217,929 donations identified 162 TPs; 87 were detected by MP (rate of 0.008%) and 75 by ID (rate of 0.10%; p < 0.0001). There were 34 ID-NAT yield cases, including 4 IgM/immunoglobulin G (IgG)-negative and 9 IgM-positive/IgG-negative donations. Rates of yield cases by primary, neighbor, and self-triggering were 0.077, 0.052, and 0.004% (p = 0.0003). None of 11 ID-NAT yield cases detected by the neighbor trigger would have been detected if the primary trigger had been used. CONCLUSIONS: Primary triggering criteria identified 21 viremic donations that would have been missed by MP testing; however, 11 other low-level viremic donations required more stringent criteria (e.g., neighbor trigger) for detection. It is reasonable to adopt more stringent ID-NAT triggers, including elimination of the rate criterion and triggering on one NAT-reactive donation for regions adjacent to centers which have already triggered.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».