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Enregistrement W1991913608 · doi:10.1089/088922202320567851

Translation of Pr55 <sup> <i>gag</i> </sup> Augments Packaging of Human Immunodeficiency Virus Type 1 RNA in a <i>Cis</i> -Acting Manner

2002· article· en· W1991913608 sur OpenAlexafffund
Chen Liang, Jing Hu, Rodney S. Russell, Mark A. Wainberg

Notice bibliographique

RevueAIDS Research and Human Retroviruses · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRNABiologyGroup-specific antigenVirusCapsidMessenger RNAAntisense RNAVirologyCell biologyMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The full-length RNA of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) serves both as a messenger (mRNA) to direct the translation of Pr55(gag) proteins and as genomic or viral particle RNA (vpRNA) to be packaged into virions. In this study, we have assessed a putative cis-acting effect of Pr55(gag) translation on HIV-1 RNA packaging. To pursue this subject, we have measured the relative competence of two distinct types of HIV-1 RNA for being packaged by virus particles under conditions in which only one of them is permissive for production of Pr55(gag). Not surprisingly, wild-type BH10 RNA was packaged at far higher efficiency than that associated with mutant viral RNA that was deleted of RNA packaging signals and incapable of Pr55(gag) production. However, when production of Pr55(gag) was eliminated from the wild-type BH10 viral RNA by insertion of stop codons either in matrix (MA) or in capsid (CA) sequences, regardless of retention of wild-type RNA packaging signals, these Pr55(gag)-deficient viral RNAs were packaged at low levels similar to those observed with viral RNA species that lack RNA packaging signals and are capable of Pr55(gag) generation. Moreover, loss of Pr55(gag) production did not affect stability of the relevant viral RNA; this observation rules out the possibility that lowered packaging efficiency associated with Pr55(gag)-deficient HIV-1 RNA is a result of reduced RNA stability. Taken together, our data demonstrate that cis translation of Pr55(gag) is needed for efficient packaging of HIV-1 RNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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