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Enregistrement W1991960619 · doi:10.1158/1538-7445.am10-3133

Abstract 3133: In vitro modeling of human pancreatic duct epithelial cell transformation

2010· article· en· W1991960619 sur OpenAlexaffabout
Lisa Leung, Nikolina Radulovich, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASPancreatic ductPancreatic cancerCancer researchOncogeneCarcinogenesisBiologyCell cultureTumor suppressor genePancreasCell growthCellCancerGeneCell cycleMutationEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Pancreatic cancer is the fifth most common cause of cancer death in North America and has an overall 5-year survival rate of less than 5%. Over 90% of tumours are ductal carcinoma (PDAC), which putatively arise from the pancreatic ducts. In PDAC, KRAS oncogene activation occurs in approximately 90% of cases, while SMAD4 tumour suppressor gene inactivation occurs in around 55% of cases. We hypothesize that introduction of multiple genetic aberrations into pancreatic epithelial cells derived from normal ducts may provide a dynamic model to study pancreatic duct cell carcinogenesis. Materials and Methods: We have isolated another cell line from the H6c7 immortalized near normal pancreatic duct epithelial (HPDE) cell line called TβR. TβR cells were generated by growing the H6c7 cells in progressively increasing concentrations of TGF-β and are resistant to growth inhibition by TGFβ. Overexpression of KRASG12V in TβR gave rise to TβR-KRAS cells. Results: Spectral karyotypic analysis of TβR cells revealed paradiploidy but with the loss of one copy of chromosome 18, on which the Smad4 gene resides. Q-PCR and Western blot confirmed the lost of Smad4 expression in this cell line. TβR cells demonstrated increased invasiveness as compared to the parental H6c7 cell line, and this is further enhanced in TβR-KRAS cells. The TGF-β-Smad4 signaling pathway was disrupted in both the TβR and TβR-KRAS cell lines. This resulted in the loss of responsiveness to TGF-β and the repressed expression of Smad4 responsive genes. The subcutaneous injection of the TβR-KRAS induced in tumor growth in SCID mice. Conclusion: The complete loss of Smad4 expression cooperates with KRASG12V oncogene to induce tumorigenicity in H6c7 cells. This provides a dynamic in vitro model to study the gene expression changes that characterize the key molecular events that occur during pancreatic ductal carcinogenesis. (Supported by the Canadian Institutes of Health Research grant MOP-49585) Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 3133.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,443
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission2
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