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Enregistrement W1991967891 · doi:10.4141/cjps09066

Identification of differentially expressed proteins of a new rice mutant with albino green-revertible trait in the seedling stage

2010· article· en· W1991967891 sur OpenAlexvenueno aff
Hong Zeng

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyMutantChloroplastOryza sativaChlorophyllSeedlingGeneBotanyMolecular biologyCell biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chlorophyll-deficient mutants have been employed to study the mechanism of chlorophyll and chloroplast biogenesis in plants. We found a new chlorophyll-deficient mutant rice line (W02S) whose leaves, unlike those of its isogenic line (Peiai64S), became etiolated at the two-leaf stage and turned green at the three-leaf stage. 2-D gel electrophoresis was performed, and proteins that were differentially expressed between W02S and Peiai64S were selected for MALDI-TOF MS analysis. A total of 44 highly differentially expressed proteins were collected from the two-leaf stage of W02S. These 44 proteins can be classified into 10 categories, 15 were novel and unknown functional proteins, 6 proteins participated in the EMP-TCA-ETC pathway, and 4 proteins were involved in the in signal transduction. Four representative protein spots were selected for real-time quantitative PCR analysis. The mRNA levels of three genes encoding an enolase, a chloroplast 29 kDa ribonucleoprotein and a proteasome alpha subunit were significantly increased in the samples from the two-leaf stage of W02S, indicating that a substantial proportion of protein changes is the consequence of altered mRNA levels during the seedling stages of the mutant rice. These findings provide new insights into the mechanisms for chlorophyll-deficient mutant rice and other plants as well.Key words: Oryza sativa L., 2-D gel , real time PCR, chlorophyll-deficient mutant

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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