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Enregistrement W1991972249 · doi:10.1242/jeb.026906

Variation in yolk precursor receptor mRNA expression is a key determinant of reproductive phenotype in the zebra finch (<i>Taeniopygia guttata</i>)

2009· article· en· W1991972249 sur OpenAlexaff
Dong Han, Norbert H. Haunerland, Tony D. Williams

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVery low-density lipoproteinEndocrinologyVitellogenesisInternal medicineZebra finchTaeniopygiaYolkVitellogeninOocyteMessenger RNAOvarian follicleOvaryLipoproteinCell biologyGeneGeneticsCholesterolEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vitellogenin/very low density lipoprotein receptor (VTG/VLDL-R), a 95 kDa protein that belongs to the low density lipoprotein receptor gene family, mediates the uptake of yolk precursors by developing follicles during oocyte growth. However, the extent to which variation in VTG/VLDL-R expression plays a role in determining inter-individual variation in reproductive phenotype (e.g. follicle or egg size) is not known. Here we show that the mRNA sequence of the zebra finch (Taeniopygia guttata) VTG/VLDL-R shows a high degree of sequence identity (92%) with chicken VTG/VLDL-R mRNA. Using quantitative real-time PCR we measured transcriptional expression of VTG/VLDL-R mRNA in various tissues, and for different stages of oocyte growth, in individual female zebra finches. VTG/VLDL-R mRNA was expressed at high levels in vitellogenic oocytes and in skeletal muscle, and was also detectable in liver, but these tissues expressed different splice variants: the short-form LR8-in oocytes and liver, and the LR8+ form in skeletal muscle. There was significant temporal variation in VTG/VLDL-R expression during follicle growth, with highest levels in ovary and a gradual decrease from pre-F3 to F1 vitellogenic follicles. Variation in ovary mRNA expression was correlated with inter-individual variation in clutch size and laying interval. Furthermore, variation in F3 follicle VTG/VLDL-R mRNA expression was correlated with inter-individual variation in egg mass and F1 follicle mass, suggesting that VTG/VLDL receptor mRNA expression is a key determinant of inter-individual variation in reproductive phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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