Variation in yolk precursor receptor mRNA expression is a key determinant of reproductive phenotype in the zebra finch (<i>Taeniopygia guttata</i>)
Notice bibliographique
Résumé
The vitellogenin/very low density lipoprotein receptor (VTG/VLDL-R), a 95 kDa protein that belongs to the low density lipoprotein receptor gene family, mediates the uptake of yolk precursors by developing follicles during oocyte growth. However, the extent to which variation in VTG/VLDL-R expression plays a role in determining inter-individual variation in reproductive phenotype (e.g. follicle or egg size) is not known. Here we show that the mRNA sequence of the zebra finch (Taeniopygia guttata) VTG/VLDL-R shows a high degree of sequence identity (92%) with chicken VTG/VLDL-R mRNA. Using quantitative real-time PCR we measured transcriptional expression of VTG/VLDL-R mRNA in various tissues, and for different stages of oocyte growth, in individual female zebra finches. VTG/VLDL-R mRNA was expressed at high levels in vitellogenic oocytes and in skeletal muscle, and was also detectable in liver, but these tissues expressed different splice variants: the short-form LR8-in oocytes and liver, and the LR8+ form in skeletal muscle. There was significant temporal variation in VTG/VLDL-R expression during follicle growth, with highest levels in ovary and a gradual decrease from pre-F3 to F1 vitellogenic follicles. Variation in ovary mRNA expression was correlated with inter-individual variation in clutch size and laying interval. Furthermore, variation in F3 follicle VTG/VLDL-R mRNA expression was correlated with inter-individual variation in egg mass and F1 follicle mass, suggesting that VTG/VLDL receptor mRNA expression is a key determinant of inter-individual variation in reproductive phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».