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Enregistrement W1992159725 · doi:10.1007/s10545-010-9148-9

Diagnosis and high incidence of hyperornithinemia‐hyperammonemia‐homocitrullinemia (HHH) syndrome in northern Saskatchewan

2010· article· en· W1992159725 sur OpenAlexaffabout
AbdulRazaq Sokoro, Joyce Lepage, Nick A. Antonishyn, Ryan McDonald, Cheryl R. Greenberg, James Irvine, Denis C. Lehotay

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanSaskatchewan HealthSaskatchewan Disease Control LaboratoryUniversity of ManitobaShared HealthHealth Sciences CentreWinnipeg Regional Health AuthorityManitoba Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNewborn screeningPopulationHyperammonemiaPeroxisomal disorderAllele frequencyBiologyGeneticsAlleleMedicineEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the SLC25A15 gene, encoding the human inner mitochondrial membrane ornithine transporter, are thought to be responsible for hyperornithinemia-hyperammonemia-homocitrullinemia (HHH) syndrome, a rare autosomal recessive condition. HHH syndrome has been detected in several small, isolated communities in northern Saskatchewan (SK). To determine the incidence of HHH syndrome in these communities, a PCR method was set up to detect F188Δ, the common French-Canadian mutation. Neonatal blood spots collected from all newborns from the high risk area were genotyped for the F188Δ mutation for seven consecutive years. Using DNA analysis, we estimated that the heterozygote frequency for the mutant allele for HHH syndrome to be about 1 in 19 individuals, predicting one affected child with HHH syndrome for approximately every 1,500 individuals (1 in 1,550 live births; 1 child every 12 years) in this isolated population. The frequency for the mutant allele for HHH syndrome in this isolated community is probably the highest in the world for this rare disorder. We determined that ornithine levels, by tandem mass spectrometry, were not abnormal in newborns with F188Δ mutation, carriers and normals. Ornithine rises to abnormally high levels at some time after birth well past the time that the newborn screening blood spot is collected. The timing or the reasons for the delayed rise of ornithine in affected children with HHH syndrome have not been determined. Newborn screening for HHH Syndrome in this high risk population is only possible by detection of the mutant allele using DNA analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,326
Score d'incertitude au seuil0,894

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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