Molecular Interactions of the Gβ Binding Domain of the Ste20p/PAK Family of Protein Kinases
Notice bibliographique
Résumé
The transmission of the mating signal of the budding yeast Saccharomyces cerevisiae requires Ste20p, a member of the serine/threonine protein kinases of the Ste20p/PAK family, to link the Gbeta subunit of the heterotrimeric G protein to the mitogen-activated protein kinase cascades. The binding site of Ste20p to the Gbeta subunit was mapped to a consensus sequence of SSLphiPLI/VXphiphibeta (X for any residue; phi for A, I, L, S or T; beta for basic residues), which was shown to be a novel Gbeta binding (GBB) motif present only in the noncatalytic C-terminal domains of the Ste20p/PAK family of protein kinases (Leeuw, T., Wu, C., Schrag, J. D., Whiteway, M., Thomas, D. Y., and Leberer, E. (1998) Nature 391, 191-195; Leberer, E., Dignard, D., Thomas, D. Y., and Leeuw, T. (2000) Biol. Chem. 381, 427-431). Here, we report the results of an NMR study on two GBB motif peptides and the entire C-terminal domain derived from Ste20p. The NMR data show that the two peptide fragments are not uniquely structured in aqueous solution, but in the presence of 40% trifluoroethanol, the longer 37-residue peptide exhibited two well defined, but flexibly linked helical structure elements. Heteronuclear NMR data indicate that the fully functional 86-residue C-terminal domain of Ste20p is again unfolded in aqueous solution but has helical secondary structure preferences similar to those of the two peptide fragments. The NMR results on the two GBB peptides and the entire GBB domain all indicate that the two important binding residues, Ser(879) and Ser(880), are located at the junction between two helical segments. These experimental observations with the prototype GBB domain of a novel family of Gbeta-controlled effectors may have important implications in understanding the molecular mechanisms of the signal transduction from the heterotrimeric G protein to the mitogen-activated protein kinase cascade.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».