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Enregistrement W1992228551 · doi:10.1021/bi010460k

Structural Requirements for Conserved Arginine of Parathyroid Hormone

2001· article· en· W1992228551 sur OpenAlexaff
Jean-René Barbier, Suzanne MacLean, J. F. Whitfield, Paul Morley, Gordon E. Willick

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryNorleucineStereochemistryArginineAmino acidSide chainAlaninePeptideResidue (chemistry)Polyproline helixBiochemistryLeucine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arg-20 is one of two residues conserved in all peptides known to activate the parathyroid hormone (PTH) receptor. Previous studies have failed to find any naturally encoded analogues of residue 20 that had any adenylyl cyclase (AC) stimulating activity. In this work we have studied substitutions of Arg-20 with nonencoded amino acids and conformationally constrained analogues with side chains mimicking that of Arg. No analogue had more than 20% of the AC-stimulating ability of the natural Arg-20-bearing peptide. In descending order of activity, the most active analogues had (S)-4-piperidyl-(N-amidino)glycine (PipGly), norleucine (Nle), citrulline (Cit), or ornithine (Orn) at residue 20. Analogues with Arg-20 substituted with L-4-piperidyl-(N-amidino)alanine, Lys, Glu, Ala, Gln, (S)-2-amino-4-[(2-amino)pyrimidinyl]butanoic acid, or L-(4-guanidino)phenylalanine had very low or negligible activity. Low or negligible activities of Lys or Orn analogues suggested ionic interactions play a minor role in the Arg interaction with the receptor. The conformational constraints imposed by the PipGly ring had a negative effect on its ability to substitute for Arg. The side-chain H-bonding potential of the Cit ureimido group was likely an important factor in its mimicry of Arg. The increase in amphiphilicity, as demonstrated by its greater high-performance liquid chromatographic retention, and increased alpha-helix, as shown by circular dichroic spectroscopy, likely contributed to the activity of the Nle-20 analogue. The data demonstrated that specific H-bonding, hydrophobicity of the side chain, stabilization of alpha-helix, and possibly specific cation positioning were all important in the interaction of Arg-20 with receptor groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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