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Enregistrement W1992314154 · doi:10.1074/jbc.m114.616920

A Lettuce (Lactuca sativa) Homolog of Human Nogo-B Receptor Interacts with cis-Prenyltransferase and Is Necessary for Natural Rubber Biosynthesis

2014· article· en· W1992314154 sur OpenAlexaff
Yang Qu, Romit Chakrabarty, Hue Tran, Eun-Joo Gina Kwon, Moonhyuk Kwon, Trinh‐Don Nguyen, Dae‐Kyun Ro

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrenyltransferaseHevea brasiliensisBiologyBiochemistryBiosynthesisYeastLactucaEndoplasmic reticulumNatural rubberCell biologyGeneBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural rubber ( cis -1,4-polyisoprene) is an indispensable biopolymer used to manufacture diverse consumer products. Although a major source of natural rubber is the rubber tree ( Hevea brasiliensis ), lettuce ( Lactuca sativa ) is also known to synthesize natural rubber. Here, we report that an unusual cis -prenyltransferase-like 2 ( CPTL2 ) that lacks the conserved motifs of conventional cis -prenyltransferase is required for natural rubber biosynthesis in lettuce. CPTL2 , identified from the lettuce rubber particle proteome, displays homology to a human NogoB receptor and is predominantly expressed in latex. Multiple transgenic lettuces expressing CPTL2-RNAi constructs showed that a decrease of CPTL2 transcripts (3–15% CPTL2 expression relative to controls) coincided with the reduction of natural rubber as low as 5%. We also identified a conventional cis -prenyltransferase 3 ( CPT3 ), exclusively expressed in latex. In subcellular localization studies using fluorescent proteins, cytosolic CPT3 was relocalized to endoplasmic reticulum by co-occurrence of CPTL2 in tobacco and yeast at the log phase. Furthermore, yeast two-hybrid data showed that CPTL2 and CPT3 interact. Yeast microsomes containing CPTL2/CPT3 showed enhanced synthesis of short cis -polyisoprenes, but natural rubber could not be synthesized in vitro . Intriguingly, a homologous pair CPTL1/CPT1, which displays ubiquitous expressions in lettuce, showed a potent dolichol biosynthetic activity in vitro . Taken together, our data suggest that CPTL2 is a scaffolding protein that tethers CPT3 on endoplasmic reticulum and is necessary for natural rubber biosynthesis in planta , but yeast-expressed CPTL2 and CPT3 alone could not synthesize high molecular weight natural rubber in vitro .Natural rubber biosynthesis in lettuce ( Lactuca sativa ) and other plants remains elusive. Results An unusual cis -prenyltransferase-like protein interacts with and tethers a cis -prenyltransferase on endoplasmic reticulum, and its RNAi-silencing eliminates natural rubber. Conclusion cis -Prenyltransferase-like protein is a necessary component in natural rubber biosynthesis in lettuce. Significance The results presented here suggest hetero-protein complexes are involved in natural rubber biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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