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Enregistrement W1992333361 · doi:10.1074/jbc.m312459200

Camptothecin-sensitive Relaxation of Supercoiled DNA by the Topoisomerase I-like Activity Associated with Poly(ADP-ribose) Polymerase-1

2004· article· en· W1992333361 sur OpenAlexafffund
Tetsu M.C. Yung, Marianne Parent, Erick L.Y. Ho, Masahiko S. Satoh

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTopoisomeraseCamptothecinPolymeraseDNA supercoilPoly ADP ribose polymeraseChemistryDNA polymeraseDNABiophysicsMolecular biologyBiochemistryBiologyDNA replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Poly(ADP-ribose) polymerase-1 is a highly abundant nuclear enzyme implicated in transcription, DNA replication, and DNA repair through binding of nascent RNA and interactions with various factors. We found that purified fractions of recombinant human poly(ADP-ribose) polymerase-1 expressed in Escherichia coli possess yet another activity, a Mg(2+)-dependent DNA supercoil relaxation activity. Cleavage of recombinant poly(ADP-ribose) polymerase-1 by caspase-3, an apoptotic protease, reduced this activity, as did the removal of either of the two zinc finger motifs located in the N-terminal DNA-binding domain of poly(ADP-ribose) polymerase-1. In addition, this activity was separated from E. coli topoisomerase I by gel-filtration column chromatography, suggesting that this activity is specifically associated with poly(ADP-ribose) polymerase-1. Because this relaxation activity did not require ATP and was resistant to VP16, a topoisomerase II inhibitor, this activity is closer to that of topoisomerase I. However, the supercoiled DNA relaxation activity associated with poly(ADP-ribose) polymerase-1 is distinct from that of human or E. coli topoisomerase I, as this activity could not completely remove superhelical tensions from plasmid DNA. Thus, we referred to this activity as topoisomerase I-like activity. This Mg(2+)-dependent DNA supercoil relaxation activity was found to be sensitive to camptothecin, a mammalian topoisomerase I inhibitor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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