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Enregistrement W1992407013 · doi:10.1111/j.1574-6941.2011.01220.x

Distinct commensal bacteria associated with ingesta and mucosal epithelium in the gastrointestinal tracts of calves and chickens

2011· article· en· W1992407013 sur OpenAlexafffund
Nilusha Malmuthuge, Meiju Li, Yanhong Chen, Patrick Fries, Philip Griebel, B. Baurhoo, Xin Zhao, Le Luo Guan

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of SaskatchewanUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyCecumIleumGastrointestinal tractTemperature gradient gel electrophoresisCaecumBacteriaJejunumFecesMicrobiologyPopulationGut microfloraInternal medicineEcology16S ribosomal RNAEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The primary aim of this study was to determine whether distinct gastrointestinal tract (GIT) microbial communities are established within ingesta and on mucosal surfaces of dairy calves and chickens to evaluate whether the principle of microbial segregation is of broad biological significance. Multivariate analysis of the predominant bacterial PCR-denaturing gradient gel electrophoresis profiles and estimated bacterial populations were compared in rumen, jejunum, ileum, cecum, and colon ingesta and matching mucosal tissues. Samples collected from 3-week old (n = 8) and 6-month old (n = 8) calves revealed that the predominant mucosa-associated bacteria were distinct from those inhabiting ingesta, and bacterial diversity varied significantly among the GIT regions. The estimated bacterial populations displayed significant regional differences for bovine mucosal (P = 0.05) and for ingesta (P = 0.03) only at 6 months of age. This indicates an established segregation of the enteric bacterial population throughout the GIT in weaned calves. Analysis of ileal and cecal bacterial profiles in chickens confirmed that the segregation of commensal bacteria between ingesta and the mucosal tissue was a common biological phenomenon. Our study provides some fundamental understanding of the impact of sample type (mucosa vs. ingesta), region, and host age on commensal bacterial establishment and segregation throughout the GIT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,546
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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