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Enregistrement W1992543365 · doi:10.1002/ajmg.1587

Linkage study in families with posterior helical ear pits and Wiedemann-Beckwith Syndrome

2001· article· en· W1992543365 sur OpenAlexaff
Cathy L. Barr, Lyle G. Best, Rosanna Weksberg

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoToronto Western HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPedigree chartGeneticsBeckwith–Wiedemann syndromeGenetic linkageBiologyPenetranceHaplotypePhenotypeLinkage (software)GeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Wiedemann-Beckwith syndrome (WBS) is defined by a group of anomalies, including macrosomia, macroglossia, omphalocele, and ear creases. Several minor anomalies have also been reported in the syndrome, including posterior helical ear pits (PHEP). Two independent linkage studies of pedigrees with autosomal dominant inheritance have shown linkage of WBS to 11p15.5 markers. Further confirming the location of WBS to this location is the finding of 11p15.5 duplications and translocations, as well as uniparental disomy for a small area of 11p15.5. In this study, members of previously described families exhibiting autosomal dominant inheritance of the PHEP phenotype were genotyped for three markers in the 11p15.5 region. These three markers were in the insulin-like growth factor (IGF2), insulin (INS), and tyrosine hydroxylase (TH) region. The data were examined by linkage analysis using the same genetic model used previously to demonstrate linkage of WBS to markers on chromosome 11p15.5: an autosomal dominant model with a penetrance of 0.90 and a gene frequency of 0.001. In one large pedigree, linkage analysis of the 11p15.5 markers excluded the PHEP phenotype from the IGF2, INS, and TH region. In the four other pedigrees examined, the marker loci were not sufficiently informative or the pedigrees did not provide sufficient power to exclude linkage from this region. The strongest evidence against linkage of the PHEP phenotype to 11p15.5 was evident by inspection of the segregation of the haplotypes of the markers in the pedigrees. In two informative pedigrees, relatives with the PHEP phenotype did not share the same haplotype of markers identical by descent. Our results show that the PHEP phenotype is not linked to chromosome 11p15.5 in the informative families tested. In the families examined, there are not enough individuals with WBS to determine if WBS was linked to 11p15.5 in these families. Although locus heterogeneity has not been demonstrated in WBS, it is possible that a second WBS locus exists and that the PHEP phenotype in these families is linked to a second WBS locus. Alternatively, the PHEP phenotype may occur independently of WBS so that the association of WBS and PHEP in our pedigrees may, in fact, represent causal heterogeneity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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