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Enregistrement W1992666445 · doi:10.1002/jcb.10178

Characterization of a TM‐4 type tropomyosin that is essential for myofibrillogenesis and contractile activity in embryonic hearts of the Mexican axolotl*

2002· article· en· W1992666445 sur OpenAlexaff
Belinda J. Spinner, Robert W. Zajdel, Matthew D. McLean, Christopher R. Denz, Syamalima Dube, Sonali Mehta, Aruna Choudhury, Masako Nakatsugawa, Nancy Dobbins, Larry F. Lemanski, Dipak K. Dube

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensShared Services Canada
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthAmerican Heart Association
Mots-clésTropomyosinMolecular biologyAxolotlBiologyGene isoformMyofibrilEmbryonic heartCardiac muscleExonGeneCell biologyMyosinBiochemistryAnatomyEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A striated muscle isoform of a Tropomyosin (TM-4) gene was characterized and found to be necessary for contractile function in embryonic heart. The full-length clone of this isoform was isolated from the Mexican axolotl (Ambystoma mexicanum) and named Axolotl Tropomyosin Cardiac-3 (ATmC-3). The gene encoded a cardiac-specific tropomyosin protein with 284 amino acid residues that demonstrated high homology to the Xenopus cardiac TM-4 type tropomyosin. Northern blot analysis indicates a transcript of approximately 1.25 kb in size. RT-PCR and in situ hybridization demonstrated that this isoform is predominantly in cardiac tissue. Our laboratory uses an animal model that carries a cardiac lethal mutation (gene c), this mutation results in a greatly diminished level of tropomyosin protein in the ventricle. Transfection of ATmC-3 DNA into mutant hearts increased tropomyosin levels and promoted myofibrillogenesis. ATmC-3 expression was blocked in normal hearts by transfection of exon-specific anti-sense oligonucleotide (AS-ODN). RT-PCR confirmed lower transcript expression of ATmC-3 and in vitro analysis confirmed the specificity of the ATmC-3 exon 2 anti-sense oligonucleotide. These AS-ODN treated hearts also had a disruption of myofibril organization and disruption of synchronous contractions. These results demonstrated that a striated muscle isoform of the TM-4 gene was expressed embryonically and was necessary for normal structure and function of the ventricle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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