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Enregistrement W1992685217 · doi:10.1139/b04-084

Selection of algal genotypes by three species of lichen fungi in the genus<i>Cladonia</i>

2004· article· en· W1992685217 sur OpenAlexfundvenueaboutno aff
Michele D. Piercey‐Normore

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésCladoniaBiologyInternal transcribed spacerGenusLichenPhylogenetic treePhylogeneticsBotanyRibosomal DNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lichen-forming fungal genus Cladonia P. Browne associates with green algae in the genus Trebouxia de Puymaly. Genetic structure of the algal symbionts in Cladonia gracilis (L.) Willd., Cladonia multiformis G. Merr., and C. rangiferina (L.) Nyl. was used to infer geographic patterns and symbiont associations. Algal genotypes were defined by restriction fragment length polymorphisms in the nuclear internal transcribed spacer rDNA from 115 samples of Cladonia collected from two geographic regions in Manitoba, Canada. Results suggested that two species of fungal symbiont were highly selective of the algal partner within given geographic areas, and one species was highly selective of the algal partner regardless of the geographic region. Different degrees of selectivity in three species suggested that even within the same genus, fungal selection for the algal partner may vary. In addition, DNA sequences from a subsample of 20 algal and 11 fungal specimens were used to determine phylogenetic relationships of each symbiont. Sequences of four group I intron-like insertions in the small subunit rDNA, two of which were newly reported for the genus Cladonia, were used to infer the fungal phylogeny. The intron phylogenies produced monophyletic species. Sequences of the internal transcribed spacer rDNA were used to infer the algal phylogeny. Cladonia gracilis and C. rangiferina were associated with three species of Trebouxia.Key words: selectivity, Cladonia, Trebouxia, phylogeny, geographic pattern.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,690
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2004
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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