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Enregistrement W1992690229 · doi:10.1021/jp071894d

Effect of Double Bond Position on Lipid Bilayer Properties:  Insight through Atomistic Simulations

2007· article· en· W1992690229 sur OpenAlexfundno aff
Hector Martinez‐Seara, Tomasz Róg, Marta Pasenkiewicz‐Gierula, Ilpo Vattulainen, Mikko Karttunen, Ramón Reigada

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDouble bondDegree of unsaturationLipid bilayerMembraneBilayerChemistryLipid bilayer phase behaviorMolecular dynamicsBond orderCrystallographyChemical physicsBond lengthComputational chemistryOrganic chemistryCrystal structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylcholines (PCs) are among the most common phospholipids in plasma membranes. Their structural and dynamic properties are known to be strongly affected by unsaturation of lipid hydrocarbon chains, yet the role of the exact positions of the double bonds is poorly understood. In this work, we shed light on this matter through atomic-scale molecular dynamics simulations of eight different one-component lipid bilayers comprised of PCs with 18 carbons in their acyl chains. By introducing a single double bond in each acyl chain and varying its position in a systematic manner, we elucidate the effects of a double bond on various membrane properties. Studies in the fluid phase show that a number of membrane properties depend on the double bond position. In particular, when the double bond in an acyl chain is located close to the membrane-water interface, the area per lipid is considerably larger than that found for a saturated lipid. Further, when the double bond is shifted from the interfacial region toward membrane center, the area per lipid is observed to increase and have a maximum when the double bond is in the middle of the chain. Beyond this point, the surface area decreases systematically as the double bond approaches membrane center. These changes in area per lipid are accompanied by corresponding changes in membrane thickness and ordering of the chains. Further changes are observed in the tilt angles of the chains, membrane hydration together with changes in the number of gauche conformations, and direct head group interactions. All of these effects can be associated with changes in acyl chain conformations and local effects of the double bond on the packing of the surrounding atoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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