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Enregistrement W1992747448 · doi:10.1139/w09-018

Disruption of the 2-methylcitric acid cycle and evaluation of poly-3-hydroxybutyrate-<i>co</i>-3-hydroxyvalerate biosynthesis suggest alternate catabolic pathways of propionate in<i>Burkholderia sacchari</i>

2009· article· en· W1992747448 sur OpenAlexvenueno aff
Erica Mendes Pereira, Sonia Regina Silva-Queiroz, José Gregório Cabrera Gomez, Luiziana Ferreira da Silva

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésPropionateChemistryBiochemistryFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of the present work was to evaluate the relevance of the 2-methylcitric acid cycle (2MCC) to the catabolism of propionate in Burkholderia sacchari. Two B. sacchari mutants unable to grow on propionate were obtained: one disrupted in acnM, and the other in acnM and prpC deleted. An operative 2MCC significantly reduces the bacterial ability to incorporate 3-hydroxyvalerate (3HV) into a biodegradable copolyester accumulated from carbohydrates plus propionate. The efficiency of the mutants in converting propionate to 3HV units (Y(3HV/prp)) increased from 0.09 g*g(-1) to 0.81-0.96 g*g(-1), indicating that acnM and prpC are both essential for growth on propionate. None of the mutations resulted in achievement of the maximum theoretical Y3HV/prp (1.35 g*g(-1)). When increasing concentrations of propionate were supplied, decreasing values of Y3HV/prp were observed. The results obtained corroborate the hypothesis of the presence of other propionate catabolic pathways in B. sacchari. The 2MCC would be the more operative pathway, but a second pathway, which remains to be elucidated, would assume more importance under propionate concentrations of 1 g*L(-1) or higher. The efficiency in converting propionate to 3HV units can be improved by decreasing the propionate concentrations, owing to the role of the 2MCC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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