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Enregistrement W1992852302 · doi:10.1002/humu.20231

Correlations between genotype and pharmacological, histological, functional, and clinical phenotypes in malignant hyperthermia susceptibility

2005· article· en· W1992852302 sur OpenAlexaff
Nicole Monnier, G. Kozak‐Ribbens, R Krivosic-Horber, Y. Nivoche, Qi Dong, Natasha Kraev, Julian Loke, Parveen Sharma, Vincenzo Tegazzin, Dominique Figarella-Branger, Norma B. Romero, Paulette Mezin, David Bendahan, Jean‐François Payen, T. Dépret, David H. MacLennan, Joël Lunardi

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRYR1Malignant hyperthermiaBiologyGeneticsGenotypeMyopathyPathologyGeneMedicineRyanodine receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malignant hyperthermia susceptibility (MHS) is a subclinical pharmacogenetic disorder caused by an impairment of skeletal muscle calcium homeostasis in response to triggering agents. While in vitro contracture testing (IVCT) is the gold standard for defining MHS, molecular analysis is increasingly used to diagnosis MHS. Mutations associated with MHS have been reported in two genes: RYR1 and CACNA1S. Mutations in RYR1 are also responsible for central core disease (CCD), a myopathy that can be associated with a positive IVCT response. We report here the results of correlation studies performed with molecular, pharmacological, histological, and functional data obtained in 175 families (referred to as confirmed (129) or potential (46) MHS families). Extensive molecular analysis allowed us to identify a variant in 60% of the confirmed MHS families, and resulted in the characterization of 11 new variants in the RYR1 gene. Most mutations clustered to MH1 and MH2 domains of RYR1. Functional analysis allowed us to assign a causative role for seven MHS mutations that we propose to add to the panel of MHS mutations used for genetic testing. The use of genetic data to determine MHS status led to a 99.5% sensitivity for IVCT. IVCT-positive/mutation-negative diagnoses were analyzed not only in terms of specificity for IVCT, but also to assess the presence of a second MHS trait in families, and the genetic heterogeneity of the disease. Histological analyses revealed the presence of cores in more than 20% of muscle biopsies originating from 242 genotyped and tested MHS patients who did not present with clinical symptoms. This indicates that these patients must be considered as MHS patients with cores, and are clearly differentiated from CCD patients who have been tested positive for MHS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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