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Enregistrement W1992893367 · doi:10.1021/es0124616

Peer Reviewed: Genomics technologies for environmental science

2001· review· en· W1992893367 sur OpenAlexaff
Charles W. Greer, Lyle G. Whyte, John R. Lawrence, Luke Masson, Roland Brousseau

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2001
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAltmetricsCitationSocial mediaComputer scienceWorld Wide WebIconLibrary scienceMicrobloggingBibliometricsData science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ongoing explosion of nucleotide sequence data from prokaryotic and eukaryotic organisms is creating a vast information resource. Potential applications range fromunderstanding and combating human disease to characterizing naturally occurring microbial communities, whose combined biomass is the singlemost important biological force influencing global elemental cycles and the balance of atmospheric gases. Although the health sector is moving rapidly into the postgenomics era, environmental genomics, the use of genomics to address environmental issues and problems, remains in its infancy. For example, although specific nucleotide sequence information has been available for some time, whole genome sequences for environmentally relevant microorganisms are only now beginning to appear in databases. Presently, ecological studies ofmicrobial communities remain largely process-oriented. Measurable metabolic parameters, like nitrogen fixation and substrate biodegradation, are determined as a function of the whole community. The contribution of individual bacterial species to these parameters is nearly impossible to determine becausemany organisms cannot be cultivated in vitro. The use of genomics-based tools to augment these traditional methods promises to accelerate our understanding of the complexities of species diversity, population dynamics, andmetabolic pathways withinmicrobial communities in soil and water. Their use should markedly improve the reliability and accuracy of remediation activities and of predictions of adverse environmental impacts before they happen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0030,044
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0080,011
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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