DNA Aptamer Folding on Gold Nanoparticles: From Colloid Chemistry to Biosensors
Notice bibliographique
Résumé
We have investigated the effect of the folding of DNA aptamers on the colloidal stability of gold nanoparticles (AuNPs) to which an aptamer is tethered. On the basis of the studies of two different aptamers (adenosine aptamer and K+ aptamer), we discovered a unique colloidal stabilization effect associated with aptamer folding: AuNPs to which folded aptamer structures are attached are more stable toward salt-induced aggregation than those tethered to unfolded aptamers. This colloidal stabilization effect is more significant when a DNA spacer was incorporated between AuNP and the aptamer or when lower aptamer surface graft densities were used. The conformation that aptamers adopt on the surface appears to be a key factor that determines the relative stability of different AuNPs. Dynamic light scattering experiments revealed that the sizes of AuNPs modified with folded aptamers were larger than those of AuNPs modified with unfolded (but largely collapsed) aptamers in salt solution. From both the electrostatic and steric stabilization points of view, the folded aptamers that are more extended from the surface have a higher stabilization effect on AuNP than the unfolded aptamers. On the basis of this unique phenomenon, colorimetric biosensors have been developed for the detection of adenosine, K+, adenosine deaminase, and its inhibitors. Moreover, distinct AuNP aggregation and redispersion stages can be readily operated by controlling aptamer folding and unfolding states with the addition of adenosine and adenosine deaminase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».