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Enregistrement W1992956019 · doi:10.1007/s11103-012-9982-2

Functional analysis of splice variant expression of MADS AFFECTING FLOWERING 2 of Arabidopsis thaliana

2012· article· en· W1992956019 sur OpenAlex
Sarah Marie Rosloski, Anandita Singh, Sathya Sheela Jali, Sureshkumar Balasubramanian, Detlef Weigel, Vojislava Grbić

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePlant Molecular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMax-Planck-Gesellschaft
Mots-clésBiologyspliceArabidopsisArabidopsis thalianaMADS-boxGeneGeneticsRepressorAlternative splicingVernalizationGene expressionMutantExon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The MADS-AFFECTING FLOWERING 2 (MAF2) gene of Arabidopsis thaliana has been characterized as a repressor of flowering. The molecular basis of MAF2 gene function and role of alternative MAF2 transcripts in flowering time modulation is not understood. MAF2 splice variant expression was quantified in cold-acclimated plants by quantitative RT-PCR. Cold influenced the abundance of splice variants and prompted a functional study of splice forms. Individual variants were overexpressed in the Col background and were assayed for their ability to delay flowering. Overexpression of MAF2 variants 2 and 4 had limited effect on flowering time. Overexpression of MAF2 splice variant 1 resulted in early flowering and affected the expression of the endogenous MAF2 gene and its paralogues, confounding functional assessment. In the Ll-2 Arabidopsis accession, a MAF2, MAF3, MAF4 and FLC null line, MAF2 var1 was consistent in its effect on reproductive delay under ambient and reduced temperatures, indicating that it acts as a repressor of flowering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle