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Enregistrement W1993007562 · doi:10.1139/y10-031

Extensive autolytic fragmentation of membranous versus cytosolic calpain following myocardial ischemia–reperfusion

2010· article· en· W1993007562 sur OpenAlexafffundvenue
James S.C. Gilchrist, Tom Cook, Bernard Abrenica, Babak Rashidkhani, Grant N. Pierce

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCalpainReperfusion injuryIschemiaCytosolFragmentation (computing)ChemistryAutolysis (biology)Internal medicineMyocardial ischemiaCardiologyCell biologyMedicineBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigated calpain activation in the heart during ischemia-reperfusion (I-R) by immunologically mapping the fragmentation patterns of calpain and selected calpain substrates. Western blots showed the intact 78 kDa large subunit of membrane-associated calpain was autolytically fragmented to 56 and 43 kDa signature immunopeptides following I-R. Under these conditions, the 78 kDa calpain large subunit from crude cytosolic fractions was markedly less fragmented, with only weakly stained autolytic peptides detected at higher molecular weights (70 and 64 kDa). Western blots also showed corresponding calpain-like degradation products (150 and 145 kDa) of membrane-associated alpha-fodrin (240 kDa) following I-R, but in crude myofibrils alpha-fodrin degradation occurred in a manner uncharacteristic of calpain. For control hearts perfused in the absence of ischemia, autolytic fragmentation of calpain and calpain-like alpha-fodrin degradation were completely absent from most subcellular fractions. The exception was sarcolemma-enriched membranes, where significant calpain autolysis and calpain-like alpha-fodrin degradation were detected. In purified sarcoplasmic reticulum membranes, RyR2 and SERCA2 proteins were also highly degraded, but for RyR2 this did not occur in a manner characteristic of calpain. When I-R-treated hearts were perfused with peptidyl calpain inhibitors (ALLN or ALLM; 25 micromol/L), calpain autolysis and calpain-like degradation of alpha-fodrin were equally attenuated by each inhibitor. However, only ALLN protected against early loss of developed pressure in hearts following I-R, with no functionally protective effect of ALLM observed. Our studies suggest calpain is preferentially activated at membranes following I-R, possibly contributing to impaired ion channel function implicated by others in I-R injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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