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Enregistrement W1993106701 · doi:10.1021/bi048538v

Functional Analysis of Acidic Amino Acids in the Cytosolic Tail of the Na<sup>+</sup>/H<sup>+</sup> Exchanger

2004· article· en· W1993106701 sur OpenAlexafffund
Xiuju Li, Jie Ding, Yongsheng Liu, Brenda J. Brix, Larry Fliegel

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCytosolSodium–hydrogen antiporterCalmodulinPeptide sequenceBiochemistryChemistrySize-exclusion chromatographyAmino acidTrypsinIon chromatographyBiophysicsSodiumEnzymeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian Na(+)/H(+) exchanger is a membrane protein with a C-terminal regulatory cytosolic domain and an N-terminal membrane domain. Na(+)/H(+) exchanger isoform 1 (NHE1) possesses a conserved amino acid sequence of seven consecutive acidic residues in the distal region of the cytosolic tail. We examined the structural and functional role of this acidic sequence. In human NHE1, varying mutations of the sequence (753)EEDEDDD(759) resulted in defective NHE1 activity. Mutation of the core acid sequence, (755)DED(757), or of the entire sequence caused a decrease in the activity of NHE1 in response to acute acid load. This was not due to changes in Na(+) affinity but rather due to decreased maximum velocity of the protein and delayed activation. Mutation of the target sequence did not affect the ability of the cytoplasmic domain to bind carbonic anhydrase II or tescalcin but did affect calmodulin binding. Mutation of the acidic domain also caused altered sensitivity to trypsin and changes in size of the protein in gel-filtration chromatography and sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. Our results demonstrate that the acidic sequence is critical in maintaining proper conformation of the cytosolic domain, calmodulin binding, and in maintenance of Na(+)/H(+) exchanger activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,662

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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