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Enregistrement W1993118551 · doi:10.4161/cc.5.8.2635

CARD Tricks: Controlling the Interactions of CARD6 with RICK and Microtubules

2006· review· en· W1993118551 sur OpenAlexfundno aff
Almut Dufner, Tak W. Mak

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2006
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteTerry Fox Foundation
Mots-clésBiologyMicrotubuleCell biologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, a number of proteins have been identified that contain a homotypic interaction motif called the caspase recruitment domain (CARD). Most proteins containing a CARD are involved in pathways regulating apoptosis or adaptive or innate immunity. Examples of prominent CARD proteins are caspase-9 and Apaf1, which are involved in the intrinsic death pathway; BCL10 and CARD11, which mediate antigen receptor-induced NF-kappaB activation; and receptor-interacting protein (RIP)-like interacting caspase-like apoptosis regulatory protein kinase (RICK) and the nucleotide-binding oligomerization domain (NOD) proteins, which induce NF-kappaB activation in response to intracellular bacterial peptidoglycan. The most recently discovered pathway involving CARD proteins senses virally-derived double-stranded (ds) RNA and initiates a host defense signaling program. CARD6 is a CARD-containing protein with a domain structure not shared by any other CARD protein. Although the CARD6 cDNA was deposited in GenBank five years ago, the physiological function of full-length CARD6 has yet to be reported. Here we review our initial characterization of CARD6 and discuss the functional implications of various conserved modules found in the CARD6 protein sequence. We conclude that CARD6 is structurally and potentially functionally related to the superfamily of interferon (IFN)-inducible GTPases, a growing family of host defense proteins that confer cell-autonomous immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,643

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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