Plasma proteomics can discriminate isolated early from dual responses in asthmatic individuals undergoing an allergen inhalation challenge
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: This proteomics study was designed to determine the utility of iTRAQ MALDI-TOF/TOF technology to compare plasma samples from carefully phenotyped mild, atopic asthma subjects undergoing allergen inhalation challenge. EXPERIMENTAL DESIGN: Eight adult subjects with mild, allergic asthma (four early responders (ERs) and four dual responders (DRs)) participated in the allergen inhalation challenge. Blood samples were collected prior to and 2 h after the inhalation challenge. Sixteen plasma samples (two per subject), technical replicates, and pooled controls were analyzed using iTRAQ. Technical validation was performed using LC-MRM/MS. Moderated robust regression was used to determine differentially expressed proteins. RESULTS: Although this study did not show significant differences between pre- and post-challenge samples, discriminant analysis indicated that certain proteins responded differentially to allergen challenge with respect to responder type. At pre-challenge, fibronectin was significantly elevated in DRs compared to ERs and remained significant in the multiple reaction monitoring validation. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: This proof of principle demonstration has shown that iTRAQ can uncover differences in the human plasma proteome between two endotypes of asthma and merits further application of iTRAQ to larger cohorts of asthma and other respiratory diseases.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle