MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1993156452 · doi:10.1021/bi061104a

Iron as a Bound Secondary Electron Donor in Modified Bacterial Reaction Centers

2006· article· en· W1993156452 sur OpenAlexaff
László Kálmán, Russell LoBrutto, J. C. Williams, James P. Allen

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueElectrochemical Analysis and Applications
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryFerrousReaction rate constantManganeseBacteriochlorophyllElectron paramagnetic resonanceMetalDimerBicarbonateDissociation (chemistry)Dissociation constantPhotochemistryInorganic chemistryKineticsPhysical chemistryBiochemistryNuclear magnetic resonanceOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The binding and oxidation of ferrous iron were studied in wild-type reaction centers and in mutants that have been modified to be both highly oxidizing and able to bind manganese [Thielges et al. (2005) Biochemistry 44, 7389-7394]. After illumination of wild-type reaction centers, steady-state optical spectroscopy showed that the oxidized bacteriochlorophyll dimer, P+, could oxidize iron but only as a second-order reaction at iron concentrations above 100 microM. In the modified reaction centers, P+ was reduced by iron in the presence of sodium bicarbonate with dissociation constants of approximately 1 microM for two mutants with different metal-binding sites. Transient optical spectroscopy showed that P+ was rapidly reduced with first-order rates of 170 and 275 s-1 for the two mutants. The dependence of the amplitude of this rate on the iron concentration yielded a dissociation constant of approximately 1 microM for both mutants, in agreement with the steady-state determination. The oxidation of bound iron by P+ was confirmed by the observation of a light-induced EPR signal centered at g values of 2.2 and 4.3 and attributed to high-spin Fe3+. Bicarbonate was required at pH 7 for low dissociation constants for both iron and manganese binding. The similarity between iron and manganese binding in these mutants provides insight into general properties of metal-binding sites in proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,835

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetElectrochemical Analysis and ApplicationsTravaux en français237 207