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Enregistrement W1993183417 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-3395

Abstract 3395: Role of the activating protein 2 transcription factor in regulating cell invasion and migration in malignant glioma

2014· article· en· W1993183417 sur OpenAlexaff
Saket Jain, Ho Yin Poon, Roseline Godbout

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWestern blotTranscription factorBiologyCell cultureCytoplasmTranscription (linguistics)Gene expressionCancer researchMolecular biologyGeneCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Malignant gliomas (MG) or high-grade astrocytomas are highly infiltrative brain tumors. Our previous work has shown that brain fatty acid binding protein (B-FABP) regulates the migratory properties of MG cells. B-FABP expression can be controlled by transcription factors such as NF1 and AP2. AP2 is a family of transcription factors involved in the regulation of genes responsible for cellular growth and differentiation during early development. Five AP2 genes have been identified in mice and humans: AP2α, AP2β, AP2γ, AP2δ and AP2ε. AP2 transcription factors are predominantly localized in the nucleus where they bind as homodimers or heterodimers to the consensus sequence GCCNNNGGC. Recent studies have shown that AP2α expression is inversely correlated with astrocytoma grade and that there are higher levels of AP2α in the cytoplasm of high-grade astrocytomas compared to low-grade astrocytomas. Objective: To study the regulation of B-FABP expression in response to AP2 in MG. Methodology: A panel of 10 MG cell lines was used to examine AP2α protein levels. Five of these cell lines were B-FABP +ve and five were B-FABP-ve. The effect of AP2 expression on endogenous B-FABP was examined by transfecting AP2 expression constructs into the B-FABP +ve U251 MG cell line. B-FABP levels were examined by western blot analysis and the subcellular localization of AP2 was studied by immunofluorescence analysis. Results: Western blot analysis indicates that AP2α is expressed in four out of five B-FABP-ve MG cell lines but in only one of the five B-FABP +ve MG cell lines tested. AP2 overexpression studies indicate that B-FABP levels are significantly reduced upon overexpression of AP2α, AP2β or AP2ε. Immunofluorescence data suggest preferential localization of AP2β in the cytoplasm of B-FABP +ve U251 MG cells. Our preliminary result shows difference in affinity towards heterodimerization between AP2 family members. Conclusion and future directions: AP2 is a negative regulator of B-FABP expression. Exclusion of AP2 from the nucleus allows transcription of B-FABP in MG cells, which in turn leads to increased cell migration. Experiments will be carried out to see the effect of AP2 heterodimerization on regulation of B-FABP transcription. Phosphorylation studies will be carried out to see whether AP2 phosphorylation affects its subcellular localization. This study may lead to new approaches to reduce B-FABP expression in MG, thereby reducing or preventing cell migration and tumor infiltration. Citation Format: Saket Jain, Ho Yin Poon, Roseline Godbout. Role of the activating protein 2 transcription factor in regulating cell invasion and migration in malignant glioma. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 3395. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-3395

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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