Localization of RNAs in oocytes of <i>Eleutherodactylus coqui</i>, a direct developing frog, differs from <i>Xenopus laevis</i>
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Notice bibliographique
Résumé
Eleutherodactylus coqui develops directly on land to a frog. The large 3.5-mm oocyte of E. coqui has enough yolk to allow development without a feeding tadpole. In the smaller Xenopus laevis oocyte, 1.3 mm in diameter, mRNAs involved in germ layer formation, such as VegT and Vg1, are localized to the vegetal cortex of the oocyte. We hypothesized that an animal shift has occurred in the localization of the E. coqui Orthologs of VegT and Vg1 due to the large egg size. Through a combination of degenerate reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) and rapid amplification of cDNA ends (RACE), we cloned 1634 bp of EcVegT and 1377 bp of EcVg1. Northern blot analysis shows that the lengths of these transcripts are 2.5 kb and 1.3 kb, respectively. This result suggests that we have obtained the complete Vg1 transcript, although this transcript has an extremely short 3' untranslated region compared with X. laevis, 256 bp and 1268 bp, respectively. Zygotic expression of EcVegT closely resembles that of VegT, supporting their orthology. Radioactive RT-PCR and in situ hybridization demonstrated the presence of EcVegT and EcVg1 predominantly near the animal pole of the oocyte. RT-PCR showed that the animal blastomeres, formed from the first horizontal cleavage, inherit half of the EcVegT and EcVg1 transcripts, although they contain only about 1% of the embryo volume. Our results indicate major differences between the molecular organization of the eggs of X. laevis and E. coqui.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle