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Enregistrement W1993392773 · doi:10.1118/1.3611746

SU‐E‐I‐172: Fast Computation of High Resolution LOR‐Based 3D OSEM PET Algorithm Using the GPU Device

2011· article· en· W1993392773 sur OpenAlexaff
Moulay Ali Nassiri, Philippe Després, Sami Hissoiny, Jean‐François Carrier

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensPolytechnique MontréalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlgorithmVoxelComputer scienceScannerIterative reconstructionComputationMonte Carlo methodDetectorComputer visionArtificial intelligenceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: The line‐of‐response OSEM (LOR‐OSEM) algorithm allows a PET image reconstruction from sinograms without any data compression(span=1, mashing=1). The main objective of this work is to accelerate the computation of this algorithm for modern PET scanners such as the Philips Gemini GXL by its implementation on modern GPU devices.Methods: We implemented the LOR‐OSEM algorithm on the NVIDIA Tesla 2050 GPU. The implementation incorporates the attenuation and normalization correction in the sensitivity matrix as weight factors (ANW‐LOR‐OSEM algorithm). The system matrices are built on‐the‐fly by using the multi‐ray Siddon algorithm. We used 3 rays per detector pair in the tangential direction and 2 rays in the axial direction. To reduce this computation time, the symmetries of the scanner were exploited. This implementation was validated using Monte Carlo simulated data with the GATE package.Results: The reconstruction was computed for a 188×188×57 array (FOV=376 mm, 2×2×3.15 mm̂3 voxel size) and for a 144×144×57 array (FOV=576 mm, 4×4×3.15 mm̂3 voxel size). If the sinograms are pre‐corrected for attenuation and detector efficiency, and if the projection data matrix which depends only of the scanner geometry is pre‐calculated, the time to compute the LOR‐OSEM algorithm for 10 subsets, 1 iteration and 112 million coincidences is 30.5 seconds for the 188×188×57 array and 29.4 seconds for the 144×144×57 array. This time is 73.4 seconds for the 188×188×57 array and 72.7 seconds for the 144×144×57 array for the ANW‐LOR‐OSEM algorithm Conclusions: The LOR‐OSEM algorithm was successfully implemented on a Tesla C2050 GPU, including the calculation of the sensitivity matrix, for a PET system that has 85 million LORs. The reported reconstruction times are compatible with a clinical use. The NVIDIA Tesla GPU appears to be a low‐cost, high‐ performance solution for advanced PET reconstruction such as real time 4D gated reconstruction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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