A Screen for Genes of Heme Uptake Identifies the FLC Family Required for Import of FAD into the Endoplasmic Reticulum
Notice bibliographique
Résumé
Although Candida albicans and Saccharomyces cerevisiae express very similar systems of iron uptake, these species differ in their capacity to use heme as a nutritional iron source. Whereas C. albicans efficiently takes up heme, S. cerevisiae grows poorly on media containing heme as the sole source of iron. We identified a gene from C. albicans that would enhance heme uptake when expressed in S. cerevisiae. Overexpression of CaFLC1 (for flavin carrier 1) stimulated the growth of S. cerevisiae on media containing heme iron. In C. albicans, deletion of both alleles of CaFLC1 resulted in a decrease in heme uptake activity, whereas overexpression of CaFLC1 resulted in an increase in heme uptake. The S. cerevisiae genome contains three genes with homology to CaFLC1, and two of these, termed FLC1 and FLC2, also stimulated growth on heme when overexpressed in S. cerevisiae. The S. cerevisiae Flc proteins were detected in the endoplasmic reticulum and the FLC genes encoded an essential function, as strains deleted for either FLC1 or FLC2 were viable, but deletion of both FLC1 and FLC2 was synthetically lethal. FLC gene deletion resulted in pleiotropic phenotypes related to defects in cell wall integrity. High copy suppressors of this synthetic lethality included three mannosyltransferases, VAN1, KTR4, and HOC1. FLC deletion strains exhibited loss of cell wall mannose phosphates, defects in cell wall assembly, and delayed maturation of carboxypeptidase Y. Permeabilized cells lacking FLC proteins exhibited dramatic loss of FAD import activity. We propose that the FLC genes are required for import of FAD into the lumen of the endoplasmic reticulum, where it is required for disulfide bond formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».